MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium ulcerans Agy99 chromosome

Total Repeats: 99412

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008611	CGC	2	6	27	32	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118615920
2	NC_008611	CGT	2	6	45	50	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118615920
3	NC_008611	CCGGCA	2	12	89	100	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	118615920
4	NC_008611	C	6	6	122	127	0 %	0 %	0 %	100 %	118615920
5	NC_008611	CTG	2	6	184	189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118615920
6	NC_008611	AGC	2	6	199	204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118615920
7	NC_008611	ACA	2	6	273	278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118615920
8	NC_008611	CGC	2	6	305	310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118615920
9	NC_008611	CCG	2	6	311	316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118615920
10	NC_008611	GAT	2	6	319	324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118615920
11	NC_008611	GCC	2	6	337	342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118615920
12	NC_008611	AAG	2	6	386	391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118615920
13	NC_008611	CGA	2	6	396	401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118615920
14	NC_008611	AAG	2	6	460	465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118615920
15	NC_008611	CCG	2	6	516	521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118615920
16	NC_008611	CCCG	2	8	598	605	0 %	0 %	25 %	75 %	118615920
17	NC_008611	AC	3	6	652	657	50 %	0 %	0 %	50 %	118615920
18	NC_008611	CTG	2	6	658	663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118615920
19	NC_008611	CGC	2	6	666	671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118615920
20	NC_008611	GTT	2	6	690	695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118615920
21	NC_008611	TCA	2	6	746	751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118615920
22	NC_008611	TGA	2	6	762	767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118615920
23	NC_008611	CGACGT	2	12	798	809	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	118615920
24	NC_008611	TCG	2	6	815	820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118615920
25	NC_008611	AAG	2	6	845	850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118615920
26	NC_008611	TTC	2	6	865	870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118615920
27	NC_008611	GCC	2	6	927	932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118615920
28	NC_008611	C	6	6	1003	1008	0 %	0 %	0 %	100 %	118615920
29	NC_008611	AAG	2	6	1039	1044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118615920
30	NC_008611	CGA	2	6	1071	1076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118615920
31	NC_008611	CAG	2	6	1095	1100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118615920
32	NC_008611	TGC	2	6	1202	1207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118615920
33	NC_008611	TGATC	2	10	1209	1218	20 %	40 %	20 %	20 %	118615920
34	NC_008611	GCCGAC	2	12	1219	1230	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	118615920
35	NC_008611	CCA	2	6	1250	1255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118615920
36	NC_008611	ACCAC	2	10	1415	1424	40 %	0 %	0 %	60 %	118615920
37	NC_008611	CAC	2	6	1500	1505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118615920
38	NC_008611	A	6	6	2161	2166	100 %	0 %	0 %	0 %	118615921
39	NC_008611	CCA	2	6	2172	2177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118615921
40	NC_008611	CGGTGC	2	12	2184	2195	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	118615921
41	NC_008611	GTT	2	6	2206	2211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118615921
42	NC_008611	CGA	2	6	2221	2226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118615921
43	NC_008611	CCG	2	6	2280	2285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118615921
44	NC_008611	CGA	2	6	2427	2432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118615921
45	NC_008611	CCG	2	6	2490	2495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118615921
46	NC_008611	TGA	2	6	2542	2547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118615921
47	NC_008611	GGC	2	6	2605	2610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118615921
48	NC_008611	ACCG	2	8	2612	2619	25 %	0 %	25 %	50 %	118615921
49	NC_008611	GGC	2	6	2674	2679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118615921
50	NC_008611	GGC	2	6	2710	2715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118615921
51	NC_008611	CTG	2	6	2786	2791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118615921
52	NC_008611	GCA	2	6	2814	2819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118615921
53	NC_008611	GCCG	2	8	2866	2873	0 %	0 %	50 %	50 %	118615921
54	NC_008611	AC	3	6	2875	2880	50 %	0 %	0 %	50 %	118615921
55	NC_008611	GCTGA	2	10	2903	2912	20 %	20 %	40 %	20 %	118615921
56	NC_008611	TGG	2	6	2937	2942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118615921
57	NC_008611	GAA	2	6	3026	3031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118615921
58	NC_008611	CAC	2	6	3139	3144	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118615921
59	NC_008611	CGG	2	6	3225	3230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118615921
60	NC_008611	CCGA	2	8	3233	3240	25 %	0 %	25 %	50 %	118615921
61	NC_008611	CGGTT	2	10	3261	3270	0 %	40 %	40 %	20 %	118615921
62	NC_008611	TCG	2	6	3383	3388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118615922
63	NC_008611	CG	3	6	3484	3489	0 %	0 %	50 %	50 %	118615922
64	NC_008611	CCGA	2	8	3494	3501	25 %	0 %	25 %	50 %	118615922
65	NC_008611	CGA	2	6	3512	3517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118615922
66	NC_008611	CGC	2	6	3561	3566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118615922
67	NC_008611	GCA	2	6	3608	3613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118615922
68	NC_008611	CG	3	6	3614	3619	0 %	0 %	50 %	50 %	118615922
69	NC_008611	GCGG	2	8	3636	3643	0 %	0 %	75 %	25 %	118615922
70	NC_008611	TGT	2	6	3644	3649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118615922
71	NC_008611	CGG	2	6	3686	3691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118615922
72	NC_008611	TCG	2	6	3693	3698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118615922
73	NC_008611	CCGA	2	8	3729	3736	25 %	0 %	25 %	50 %	118615922
74	NC_008611	GCGT	2	8	3746	3753	0 %	25 %	50 %	25 %	118615922
75	NC_008611	TGC	2	6	3770	3775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118615922
76	NC_008611	GGC	2	6	3894	3899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118615922
77	NC_008611	GCT	2	6	3951	3956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118615922
78	NC_008611	GCG	2	6	3976	3981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118615922
79	NC_008611	CGA	2	6	4020	4025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118615922
80	NC_008611	CGC	2	6	4026	4031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118615922
81	NC_008611	GAA	2	6	4051	4056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118615922
82	NC_008611	GTT	2	6	4059	4064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118615922
83	NC_008611	GGC	2	6	4065	4070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118615922
84	NC_008611	CG	3	6	4077	4082	0 %	0 %	50 %	50 %	118615922
85	NC_008611	GT	4	8	4106	4113	0 %	50 %	50 %	0 %	118615922
86	NC_008611	GAC	2	6	4132	4137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118615922
87	NC_008611	GCCA	2	8	4177	4184	25 %	0 %	25 %	50 %	118615922
88	NC_008611	GGC	2	6	4221	4226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118615922
89	NC_008611	GCT	2	6	4233	4238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118615922
90	NC_008611	GC	3	6	4239	4244	0 %	0 %	50 %	50 %	118615922
91	NC_008611	CGA	2	6	4272	4277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118615922
92	NC_008611	GCC	2	6	4297	4302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118615922
93	NC_008611	CGG	2	6	4358	4363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118615922
94	NC_008611	CGG	2	6	4442	4447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118615922
95	NC_008611	GCCCGG	2	12	4475	4486	0 %	0 %	50 %	50 %	118615923
96	NC_008611	GCA	2	6	4494	4499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118615923
97	NC_008611	GCG	2	6	4529	4534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118615923
98	NC_008611	GCGG	2	8	4550	4557	0 %	0 %	75 %	25 %	118615923
99	NC_008611	GC	4	8	4560	4567	0 %	0 %	50 %	50 %	118615923
100	NC_008611	CGC	2	6	4595	4600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118615923
101	NC_008611	CGC	2	6	4609	4614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118615923
102	NC_008611	CG	3	6	4693	4698	0 %	0 %	50 %	50 %	118615923
103	NC_008611	GGT	2	6	4717	4722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118615923
104	NC_008611	GC	3	6	4774	4779	0 %	0 %	50 %	50 %	118615923
105	NC_008611	GT	3	6	4819	4824	0 %	50 %	50 %	0 %	118615923
106	NC_008611	CGC	2	6	4898	4903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118615923
107	NC_008611	GTG	2	6	4920	4925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118615923
108	NC_008611	CCGGC	2	10	4942	4951	0 %	0 %	40 %	60 %	118615923
109	NC_008611	CGT	2	6	4957	4962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118615923
110	NC_008611	CG	3	6	5238	5243	0 %	0 %	50 %	50 %	118615924
111	NC_008611	GAG	2	6	5255	5260	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118615924
112	NC_008611	AGA	3	9	5283	5291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118615924
113	NC_008611	CCGT	2	8	5346	5353	0 %	25 %	25 %	50 %	118615924
114	NC_008611	CAC	2	6	5399	5404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118615924
115	NC_008611	GTC	2	6	5417	5422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118615924
116	NC_008611	GCT	2	6	5476	5481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118615924
117	NC_008611	CGT	2	6	5563	5568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118615924
118	NC_008611	CGG	2	6	5587	5592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118615924
119	NC_008611	CGG	2	6	5599	5604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118615924
120	NC_008611	GTG	2	6	5628	5633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118615924
121	NC_008611	GT	3	6	5649	5654	0 %	50 %	50 %	0 %	118615924
122	NC_008611	GGT	2	6	5656	5661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118615924
123	NC_008611	AAG	2	6	5771	5776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118615924
124	NC_008611	ACC	2	6	5822	5827	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118615924
125	NC_008611	GGCGC	2	10	5848	5857	0 %	0 %	60 %	40 %	118615924
126	NC_008611	CAA	2	6	5878	5883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118615924
127	NC_008611	CGA	2	6	5905	5910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118615924
128	NC_008611	GTC	2	6	5930	5935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118615924
129	NC_008611	GAC	2	6	5936	5941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118615924
130	NC_008611	GTC	2	6	5942	5947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118615924
131	NC_008611	CCG	2	6	5955	5960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118615924
132	NC_008611	GCC	2	6	5987	5992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118615924
133	NC_008611	CGC	2	6	6003	6008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118615924
134	NC_008611	CGG	2	6	6040	6045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118615924
135	NC_008611	CAG	2	6	6092	6097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118615924
136	NC_008611	TCG	2	6	6102	6107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118615924
137	NC_008611	GAA	2	6	6227	6232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118615924
138	NC_008611	GGT	2	6	6256	6261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118615924
139	NC_008611	AAG	2	6	6281	6286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118615924
140	NC_008611	CAAGGA	2	12	6292	6303	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	118615924
141	NC_008611	GAC	2	6	6320	6325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118615924
142	NC_008611	AGC	2	6	6447	6452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118615924
143	NC_008611	CGC	2	6	6532	6537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118615924
144	NC_008611	GC	3	6	6536	6541	0 %	0 %	50 %	50 %	118615924
145	NC_008611	GCG	2	6	6559	6564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118615924
146	NC_008611	TGG	2	6	6648	6653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118615924
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148	NC_008611	ATC	2	6	6731	6736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118615924
149	NC_008611	ATC	2	6	6791	6796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118615924
150	NC_008611	ACG	2	6	6819	6824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118615924
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152	NC_008611	GTT	3	9	6904	6912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118615924
153	NC_008611	TGT	2	6	6918	6923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118615924
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156	NC_008611	AAG	2	6	7073	7078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118615924
157	NC_008611	CAA	2	6	7081	7086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118615924
158	NC_008611	TGC	2	6	7173	7178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118615924
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160	NC_008611	GCG	2	6	7199	7204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118615924
161	NC_008611	GCC	2	6	7205	7210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118615924
162	NC_008611	CGC	2	6	7253	7258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118615924
163	NC_008611	GACA	2	8	7348	7355	50 %	0 %	25 %	25 %	118615925
164	NC_008611	TGC	2	6	7359	7364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118615925
165	NC_008611	TGG	2	6	7369	7374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118615925
166	NC_008611	CAG	2	6	7409	7414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118615925
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168	NC_008611	TCG	2	6	7455	7460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118615925
169	NC_008611	CCG	2	6	7504	7509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118615925
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171	NC_008611	GC	3	6	7568	7573	0 %	0 %	50 %	50 %	118615925
172	NC_008611	ACC	2	6	7599	7604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118615925
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174	NC_008611	CGA	2	6	7783	7788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118615925
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210	NC_008611	TTC	2	6	9053	9058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118615925
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212	NC_008611	CG	3	6	9118	9123	0 %	0 %	50 %	50 %	118615925
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233	NC_008611	CGGC	2	8	10050	10057	0 %	0 %	50 %	50 %	118615926
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245	NC_008611	CG	3	6	10484	10489	0 %	0 %	50 %	50 %	118615926
246	NC_008611	GATC	2	8	10521	10528	25 %	25 %	25 %	25 %	118615926
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249	NC_008611	GAT	2	6	10584	10589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118615926
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253	NC_008611	TGA	2	6	10757	10762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118615926
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258	NC_008611	CCGAC	2	10	11372	11381	20 %	0 %	20 %	60 %	118615927
259	NC_008611	GCC	2	6	11413	11418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118615927
260	NC_008611	GCC	2	6	11422	11427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118615927
261	NC_008611	TGC	2	6	11434	11439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118615927
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263	NC_008611	CGG	2	6	11558	11563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118615927
264	NC_008611	GGT	2	6	11567	11572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118615927
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272	NC_008611	GCT	2	6	11854	11859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118615927
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372	NC_008611	CTGG	2	8	16582	16589	0 %	25 %	50 %	25 %	118615934
373	NC_008611	GC	3	6	16604	16609	0 %	0 %	50 %	50 %	118615934
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379	NC_008611	GC	4	8	16826	16833	0 %	0 %	50 %	50 %	118615935
380	NC_008611	ATCG	2	8	16923	16930	25 %	25 %	25 %	25 %	118615935
381	NC_008611	GTG	2	6	16936	16941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118615935
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385	NC_008611	CGA	2	6	17102	17107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118615935
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387	NC_008611	CGG	2	6	17148	17153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118615935
388	NC_008611	CGC	2	6	17226	17231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118615935
389	NC_008611	CTT	2	6	17238	17243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118615935
390	NC_008611	GAG	2	6	17266	17271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118615935
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393	NC_008611	GGC	2	6	17349	17354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118615935
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500	NC_008611	GAT	2	6	21984	21989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118615938

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